Workshop - Sequenciamento de nova geração

Workshop sobre

sequenciamento de

nova geração

5 e 6 de outubro, 2009

Belo Horizonte

Os métodos de sequenciamento de nova geração estão revolucionando a pesquisa genômica estrutural e funcional.  Diferentes grupos no Brasil construiram juntos um importante parque tecnológico na área.  Desafios sobre protocolos eficientes de geração de dados, métodos de lidar com o volume de dados gerados e analisá-los são alguns dos desafios na área.

Objetivos do workshop

O Workshop irá reunir a comunidade acadêmica e privada que trabalha ou trabalhará com a geração de dados com sequenciadores de nova geração de todas as plataformas.

Os objetivos são:

  • Criar um fórum para a troca de experiências e protocolos.
  • Compartilhar áreas de interesse dos grupos atuam.
  • Métodos de análise e suporte computacional.
  • Discutir meios de cooperação.
  • Discutir meios de compartilhamento de plataformas.
  • Discutir avanços tecnológicos na área

Organizadores

Grupo de Genômica e Biologia Computacional e CEBio, FIOCRUZ-Minas.

Local e data

Data: 5 (10:00 - 17:00) e 6 de outubro (9:00 - 17:00)

Local: Catado de Idéias (web), Belo Horizonte.
Rua Alves Pinto 292, Bairro Grajaú, BH, 30430-650.

As refeições no local do evento serão fornecidas aos participantes (coffee break e almoço).

Hotéis: Sugerimos hotéis na região da Savassi.  Entrem em contato com os organizadores para maiores detalhes.

Transporte do aeroporto para Belo Horizonte.
Pode ser feito por taxi ou de ônibus (Conexão Aeroporto - link).

Participantes

FIOCRUZ-Minas

  • Guilherme Oliveira
  • Jerônimo Ruiz
  • Flávio Araújo
  • Betânia Drumond
  • Adhemar Zerlotini
  • Rommel Ramos
 FIOCRUZ-Instituto Carlos Chagas
  • Christian Probst

 

 

 

 Instituto Ludwig

  • Pedro Galante

 

 Hospital Albert Einstein

  • Beatriz Reis
  • Patrícia Severino

Universidade Católica de Brasília

  • Rinaldo Wellerson Pereira

 

 Laboratório Nacional de Computação Científica

  • Luiz Gonzaga
  • Marisa Nicolas
  • Maurício Egídio Cantão

Hospital A. C. Camargo

  • Eduardo Abrantes
  • Renato Puga
  • Edgar Andrés Ochoa
  • Guilherme Marcello Queiroga Cruz
  • Gustavo Molina
  • Elisa Ferreira

 

 FIOCRUZ - IOc

  • Antônio Miranda

 

 

 

 
 

UFMG - UFPA

  • Vasco Azevedo

Applied Biosystems

  • Sheila Purim
  • Fernando Amaral
  • Patrícia Munerato
  • Rodrigo Panepucci

Roche

  • Sandra Sá
  • Felipe Braga 

 

Illumina

  • Chad Geringer

CLCbio

  • Guilherme de Souza Lima Brito

 

Participação

  • Applied Biosystems
  • Roche
  • Illumina
  • CLCbio

Agenda

Dia 5 de Outubro 
 Dia 6 de Outubro 
10:00 Boas Vindas 9:30 Applied Biosystems
10:10 Objetivos e dinâmica do workshop 10:10 Roche
10:30 Apresentações - FIOCRUZ-Minas 10:50 Coffee Break
10:50 EMBRAPA - Cenargen 11:20 Illumina
11:10 Instituto Ludwig 12:00 Discussão sobre avanços da tecnologia
11:30 FIOCRUZ - ICC 13:00 Almoço
11:50 Univ. Católica de Brasília 14:00 Discussão de grupos
12:10 Unv. Federal de Minas e do Pará 16:00 Coffee Break
12:30 IB - USP    
12:50 FIOCRUZ - IOC    
  Almoço 16:30 Discussão final
13:30 Hospital A. C. Camargo 17:00 Encerramento do workshop
13:50 Lab. Nacional Comp. Científica    
14:10 Hospital Albert Einstein    
14:30 Discussão de grupos    
15:30 Coffee Break    
16:00 Discussão de grupos    
17:00 Encerramento do dia    
20:30

Ópera Carlos Chagas (Palácio das Artes)

Parte dos eventos de comemoração de

100 anos da Doença de Chagas

  Ópera de Sílvio Barbato

Barítono Sebastião Teixeira

Orquestra Sinfônica de Minas Gerai

 

s

 

Financiamento

Patrocínio
Apoio       

 

Conclusões do Workshop

Conclusões do Workshop SNG

Fórum para troca de experiências
Foi criada uma página web (http://sng.cebio.org/).  A página tem partes que são fechadas e outras abertas a quem quiser contribuir.  O portal é colaborativo, portanto ele só terá sucesso com o envolvimento de todos.
Links de interesse foram colocados no site:
Grupo no LinkedIn – Latin American Next Generation Sequencing (colocar na página)
Website SeqAnswers (Google and Yahoo user group)
Maintain the website
Colocar os bioinformatas para conversar

Encontros
Utilizar eventos como X-meeting, SBG para encontrar
Houve apoio para a criação de um evento em SNG entre ISCB e AB3C.  Guilherme levará o assunto a diretoria da AB3C
Achamos importante realizar o treinamento de jovens já que não há RH disponível já treinado, seria também um meio de trazer novas pessoas para o campo.
Trazer experts de fora para não “reinventarmos a roda”
Envolver os cursos de pós
 

Compartilhamento
Fazer compartilhamento de scripts, pipelines (via portal web), respeitando o direito intelectual dos criadores.
Meios de cooperação e de compartilhamento de plataformas
Seria bom para forçar o grupo a trabalhar juntos
    - troca de dados para análises diferentes (CAMDA)
    - correr a mesma amostra em plataformas diferentes
 

Projetos
    - Vários projetos possíveis foram mencionados
    - Um grupo ficou de ser convidado para fazer este projeto (Guilherme Oliveira, Jerôniomo Ruiz, Rinaldo Pereira, Ana T. Vasconcelos / Marisa Nicolas, Sandro de Souza / Pedro Galante
    - Vamos buscar o envolvimento das empresas, CNPq e FAPEs

 

Gestão AMPETT - Associação Mineira de Pesquisa, Desenvolvimento e Transferência de Tecnologia - web.